目前，医院已经形成了“一院三区多门诊”的发展格局，分别是总院、抚生院区、红谷滩分院和阳明路门诊部。其中，总院位于繁华的老城区中心地带的八一大道和福州路交汇处，地铁２号线旁。抚生院区揽江入胜，位于风光迤逦的赣江江滨，是医院的新院区。医院各院区和门诊部均有地铁直达（2号线直达总院和阳明路门诊部，4号线直达抚生院区，1号线直达红谷滩分院）。

医院历史悠久，底蕴深厚。医院的前身是1954年5月创立的江西省中医实验院。1957年，医院划归江西医学院，更名为江西医学院附属中医实验院。1959年，江西中医学院成立，经江西省人民委员会批准，在中医实验院的院址兴建江西中医学院附属医院，定院名为江西省中医院（江西省中医院的院名沿用至今），是全国最早一批省级中医医院。1962年，经过三年多的建设，江西省中医院正式开业接诊。1966年，医院更名为江西中医学院附属医院。1970年，因江西中医学院被合并，医院也划归江西医科大学领导，更名为江西医科大学附属中医院。1973年，江西中医学院恢复办学，医院重新划归江西中医学院领导，更名为江西中医学院附属中医院。1990年，医院再次更名为江西中医学院附属医院。2003年，医院增挂江西省骨伤医院牌子。2013年5月，江西中医学院更名为江西中医药大学，医院也随之更名为江西中医药大学附属医院。

医院先后获得“全国医药卫生系统先进集体”、“全国卫生系统行风建设先进集体”、“全国中医药应急工作先进集体”、“全省先进基层党组织”、“全省医药卫生系统先进集体”、“江西省群众满意医院”、“南昌市民最满意医院”、“江西省百姓健康服务十佳医疗单位”、“江西省平安医院”、“江西省教育系统节能考核先进单位”等数十项荣誉称号。

医院科研平台建设成果丰硕。拥有国家中医药管理局腧穴热敏化三级实验室、国家中医药管理局热敏灸重点研究室、南方毒蛇咬伤研究中心、南方血吸虫肝病中医研究中心、江西省中西医结合临床医学研究院、江西省2011协同创新中心、江西省中医心血管疾病临床医学研究中心、江西省热敏灸临床医学研究中心、江西省肺系疾病临床医学研究中心和江西省中医妇产科疾病临床医学研究中心等省部级科研平台12个。

医院科研成就喜人。近年来先后获批国家重点基础研究发展计划（973计划）、国家自然基金、国家科技支撑、国家中医药管理局行业专项、江西省自然基金等国家级、省部级科研课题百余项。医院先后获得国家科技进步二等奖2项。江西省科技进步一等奖2项、二等奖3项、三等奖6项。医院原创发明的热敏灸技术，成功奠定了“南看江西灸”的格局。医院创办了江西热敏灸医院，并组建江西中医康复（热敏灸）联盟，并在葡萄牙、瑞典、突尼斯、山东枣庄、湖北蕲春等设有热敏灸分院。

近年来，医院秉承“精诚为医、厚德为人”院训精神，突出“用心沟通、贴心服务”服务理念，不断改善办院条件、完善就医流程、提高服务能力、改善群众就医体验，大力加强干部队伍建设，全面推进信息化建设，加强医院文化建设，扩大对外交流合作，医院综合实力显著增强。

党的十九大报告指出，“坚持中西医并重，传承发展中医药事业”。医院全面贯彻落实党的十九大精神和全国、全省卫生和健康大会精神，牢牢抓住中医药振兴发展的重大机遇，始终坚持以中医药为主体的办院方向，持续改善办院条件，强化内涵建设，推进改革创新，努力把医院建设成为国内一流的研究型中医医院，在“健康中国”、“中医药强省”战略中做出更大贡献。