盐城市妇幼保健院创建于1986年，2010年被评审为三级甲等妇幼保健院，系江苏省首批“爱婴医院”。医院是扬州大学医学院附属医院﹑江苏医药职业学院附属医院，苏州大学医学部、安徼医科大学教学医院。

医院是江苏省人民医院战略协作医院，复旦大学附属儿科医院定点合作单位,上海市红房子妇产科医院技术协作单位，医院和国内许多著名医院建立了协作关系，并定期邀请国内外知名专家来院讲学﹑坐诊、临床示教等。

医院坚持“病人至上，团队合作”的核心价值观，紧紧围绕“科技兴院﹑人才强院、管理立院”的科学发展思路，进一步加快医院发展，深化医院内涵建设，全面提升医院整体实力，整体工作取得了长足发展，已成为一所承担盐城及周边地区妇女儿童保健与医疗任务的三级甲等妇幼保健院。未来将进一步立足盐城，服务周边，辐射全省，全力打造高水平的区域性妇女儿童医疗保健中心。

医院于2019年7月整体搬迁至盐城市世纪大道31号，医院总占地面积166亩，建筑面积12.66万平方米，固定资产10多亿元。有高级职称技术服务人员150余名，博﹑硕士80余名，各类省市级人才30余名。儿科是省级临床重点专科，新生儿科是省妇幼保健重点学科。儿科、妇科、产科、新生儿科、生育技术科、麻醉科、超声科、儿保科、儿外科、儿童神经内科分别是市级医学重点学科、专科。

医院坚持内函与外延并重，着力打造跨越式发展的学科、科研、管理、服务、信息化﹑保障等系列体系。形成了以八个中心《省乳腺疾病诊疗中心盐城分中心、新生儿疾病筛查中心、新生儿听力筛查中心、新生儿视力筛查中心、生殖医学中心、产前诊断中心、新生儿急救中心、儿童心脏病救治中心）为品牌、六个学科《妇科、产科、儿内科、儿外科、新生儿科、儿童保健与康复科）为支撑、三个基地《国家级住院医师规范化培训基地协同医院﹑市儿科护理专科护士培训基地、市产科护理专科护士培训基地）为依托、三个网络《市危重新生儿及婴儿转运网络、市妇幼健康服务联合体网络、市妇幼卫生信息平台网络）为优势的科学体系。