医院始终坚持“以保健为中心，以保障生殖健康为目的，保健与临床相结合，面向基层，面向群体，预防为主”的办院方向，坚持“儿童优先，母亲安全”的服务宗旨，承担全省妇女儿童的保健、医疗、科研、教学、计划生育技术指导、健康教育培训、妇幼卫生信息管理及妇幼保健领域对外交流等任务，是全省妇幼保健业务技术指导中心，也是世界银行、世界卫生组织、联合国儿童基金会、人口基金会、英国国际发展部等妇幼保健国际项目的合作单位和兰州大学临床教学医院。2010年、2015年先后被确定为华中科技大学同济医学院和甘肃中医药大学研究生培养基地，2016年被评为甘肃中医药大学研究生联合培养省级示范基地；2014年被评为全国健康促进与教育示范基地；2015年被评为母婴友好项目示范医院。2016年首批获批“国家级儿童早期发展示范基地”，是我省唯一一家国家级儿童早期发展示范基地。

医院创建于1942年，前身为甘肃省立兰州高级助产职业学校附属产院、甘肃省妇婴保健院、甘肃省妇产科医院，1978年正式更名为甘肃省妇幼保健院，建现址，总建筑面积43993m²，开设床位300张。2012年保健医疗综合楼一期工程建成使用，开放床位1000张，建筑面积为59783m²，2014年12月，二期工程门急诊保健楼竣工投入使用，建筑面积21375m²，2015年8月，甘肃省儿童医学中心业务楼开工建设，规划建筑面积35771m²，现已投入使用。2016年负责筹建甘肃省妇女儿童医疗综合体项目（甘肃省妇幼保健院西院、甘肃省儿童医学中心西院/国家儿童区域医疗中心、安宁新城医院），总建筑面积计划为38万m²，设置床位2300张。

医院妇科为甘肃省临床医学中心，产科、新生儿科和乳腺科为甘肃省临床医学重点学科。近年来，相继建成了甘肃省生殖保健中心、甘肃省新生儿重症救护中心、甘肃省儿童早期发展中心、甘肃省产前诊断中心、甘肃省新生儿疾病筛查中心、甘肃省孕产妇急救中心、甘肃省儿童急救中心、甘肃省医学遗传学中心；甘肃省妇幼保健院生殖医学中心、乳腺微创中心、宫颈病变诊治中心、腔镜中心、生殖免疫诊疗中心、围产医学中心、盆底障碍性疾病诊治中心和心血管中心等。2010年被确定为卫生部四级妇科内镜手术培训基地，腔镜妇科和新生儿科被确定为甘肃省妇科内镜和新生儿重症救护医疗质量控制中心。2015年，获批设立甘肃省儿科临床医学中心及甘肃省小儿呼吸内镜医疗质量控制中心。2016年8月，甘肃省妇产科医疗质量控制中心、甘肃省儿科医疗质量控制中心挂靠医院。2018年12月，甘肃省儿童重症医学质量控制中心挂靠医院。

经过七十余年的艰苦创业，医院取得了长足发展，先后三次荣获“全国卫生系统先进集体”称号，为全省妇幼卫生事业做出了突出的贡献。