东南大学医学院前身为创建于1935年的中央大学医学院，其后历经南京大学医学院、中国人民解放军第五军医大学、南京铁道医学院等重要时期，2000年4月并入东南大学。经过几代人的奋斗，医学院现已发展成为东南大学培养医学与生命科学精英人才的重要基地。学院培养了一大批科学家、教育家及各行各业的杰出人才，他们为祖国的医学与生命科学教育和医药卫生事业作出了巨大贡献，其中，中国科学院院士贺林、杨焕明、樊嘉为学院八十年代培养的毕业生。

2012 年，我校获批为全国第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校，承担了拔尖创新医学人才培养模式改革试点和五年制临床医学人才培养模式改革试点两个项目，2016年顺利通过教育部临床医学专业认证。作为教育部重点建设综合性大学的医学院，坚持精英教育和培养卓越医师的理念，遵循医学和生命科学人才培养的规律，以一流的理论教学和临床实习条件，多层次的国际化学习环境，致力于培养具有扎实医学和生命科学基础，有国际化视野和人文情怀的创新型医学与生命科学专业人才。

学院拥有一支以学术造诣较深的专家教授为龙头、中青年骨干教师为主体、结构优良的教学科研队伍。有一大批从国外归来或引进的年富力强的学科带头人和获国内著名高校博士学位的中青年骨干教师。现有“长江学者奖励计划”特聘教授1名；国家杰出青年基金获得者4名；国家自然科学基金优秀青年基金获得者1名；国家“973”首席科学家2名；教育部新世纪优秀人才8名；江苏省特聘教授2名；江苏省“333”工程和“青蓝工程”学术带头人和优秀骨干教师30多名；国家、省部级“有突出贡献”的中青年专家多名。教师中有高级职称300多人，其中博士生导师70余人，硕士生导师200多人，有20多人次分别担任全国及省部级医学杂志的主编、副主编及编委等职务，20多人次担任各类中华医学会各专业学会主委、副主委和委员等（如中华医学会重症医学专业委员会主委邱海波、中华医学会放射学会副主委滕皋军等）。聘请了包括多名院士在内的国内外著名专家30多人为兼职教授。目前全日制在校生2200人，其中本科生1300人，硕士生700人，博士生200人。2006年我院首开东南大学整建制招收学位留学生先河，当年招收MBBS临床医学留学生60人，现有在校留学生400余人。

医学院拥有基础医学、临床医学、临床医学专业博士3个一级学科博士授权点，临床医学为省级重点学科，医学技术为省优势学科。目前临床医学、生物学与生物化学、药理学与毒理学、神经科学与行为科学等4个学科已进入ESI全球前1%。各学科经过长期积累，围绕医学影像、放射介入、重症医学、肾脏病学、肿瘤、神经精神疾病、器官纤维化等已经形成特色鲜明的重点研究方向，在国内具有重要影响力。

学院的研究工作以转化医学为特色、医工结合，开展多层次、多方位交叉研究，取得了丰硕的成果。近年来获得国家“973”牵头项目2项（首席），国家重点研发计划牵头项目2项、“国家杰出青年基金”项目4项，国家“973”二级课题、“863”计划10余项，国家自然科学基金重点项目、重大国际合作项目、面上项目150余项，省部级项目100余项。近三年获得国家科技进步二等奖1项，中华医学一等奖1项，教育部自然科学/科技进步一等奖3项，江苏省科技进步奖10项。近三年发表SCI论文300余篇，申请并获得授权专利30多项。

学院国际化教育走在前列，先后与美国、德国、法国、英国、瑞典等多家国际著名医学机构和大学建立了稳定的教学、科研合作关系。学院特别重视在国际合作环境中培养具有国际视野的优秀学生，每年约近20%的学生有机会到国外著名医院进行为期1-3个月的临床实习和游学交流。2013年获得国家留学基金委资助公派本科生出国实习及研学项目,每年选派10名本科同学赴德国汉堡大学、慕尼黑工业大学和瑞典乌普萨拉大学进行为期3-6个月的临床实习或毕业设计。

2016年“中德临床医学专业学位人才培养项目”获国家留学基金委研究生创新人才培养项目资助，每年选派10名临床医学专业学位硕士毕业生，赴德国汉堡大学和乌尔姆大学攻读博士学位，“中瑞合作双博士学位临床医学拔尖创新人才培养试点”项目于2018年获批准资助，每年选派5名学生赴瑞典乌普萨拉大学，通过中瑞合作，获中方瑞方双学位博士。目前我院共有来自美国、新西兰、印度、巴基斯坦、也门、布隆迪、尼日利亚、喀麦隆等40个国家的400多名留学生，就读本科与研究生。学院已形成了从本科生、硕士生、博士生、博士后到留学生的一整套人才培养体系。近年来我院每年有30名左右本科生和研究生获得国家留学基金委资助赴国外一流大学攻读博士、硕士学位，其中包括美国哈佛大学、耶鲁大学、哥伦比亚大学、斯坦福大学、约翰霍普金斯、伦敦帝国理工学院、多伦多大学、德国慕尼黑工业大学等世界一流名校进行深造。

医学院以精英教育的理念，实行一体化培养，配备学习型和研究型导师，发扬优良办学传统，充分利用综合性大学理、工、医、文、经管等多学科交叉和教学科研资源优势，着力培养基础扎实、知识面宽、能力强、素质高、适应现代医学与生命科学发展和社会需求的高层次、高素质临床医学与生命科学方面的精英人才和领军人物。2016年，由学院本科生组成的代表队获得第七届全国高等医学院校大学生临床技能竞赛华东分区赛团体特等奖和第七届全国高等医学院校大学生临床技能竞赛总决赛团体二等奖； 2013年获得第十三届大学生“挑战杯”特等奖，2014年获“创青春”全国大学生创业大赛公益创业类全国银奖，2016年获“创青春”全国大学生创业大赛公益创业类全国金奖两项。近年来研究生就业率99.5%，本科生就业率98.9%，非七年制学生读研率为34%，一大批优秀本科生被免试保送到北京协和医学院、北京大学、解放军总医院、复旦大学、北京师范大学、上海交通大学、浙江大学、中科院等国内著名高校、医疗单位读研，七年制优秀学生有机会享受国家公派留学项目到国外大学攻读博士学位。